庆医科大学创建于1956年，由上海第一医学院(现复旦大学上海医学院)分迁来渝组建而成，原名重庆医学院，1985年更名为重庆医科大学。学校是国务院学位委员会批准的首批具有博士和硕士学位授予权的单位。2008年教育部、重庆市《部市战略合作协议》确定学校为重点建设大学。
重庆医科大学附属第一医院(现复旦大学医学院)建立于1994年，是重庆市规模最大、设备最先进、技术实力最强的综合性医院。
重庆医科大学附属第二医院，是集医疗、教学、科研、预防保健为一体的国家三级甲等综合医院。前身为始建于1892年的“重庆宽仁医院”。
重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院。
